Und ja, es sind dann zwei unterschiedliche PNRs, eine für den Hin- und eine andere für den Rückflug. Das, was man vom Veranstalter bekommt, ist anscheinend die PNR der Buchung, die beide Reisen erfasst. Den Rückflug konnte ich noch nicht einchecken (es sind noch über zwei Wochen bis dahin), aber der Check-in für den Hinflug hat wunderbar funktioniert.

Das gleiche hier gewesen, die PNR von der PDF ging nicht. Holidaycheck Reisen hat mir noch nicht geantwortet, aber sonst das gleiche Problem.
Gehe einfach auf Flug verwalten -> Buchungen über Reiseveranstalter, dort die PNR von der Pdf eingeben, dann siehst Du die Reisen(sollen 2 sein) und wenn Du eine anklickst, stellst Du fest dass eine andere PNR in der BrowserAdresse steht, anscheinend sind die PNRs von Holidaycheck Reisen nicht die PNRs die eigentlich dort gemeint sind.

Ich musste aber mit der neuen PNR neu einsteigen über die alte Check-in Seite, weil da bei Reiseveranstalter kam ich nicht weiter: Der Link, auf den Sie geklickt haben, ist abgelaufen. Bitte kontaktieren Sie hierzu kostenlos unser Callcenter unter der Nummer 0850 399 17 01.(ERR_C73)

Aber die PNR aus der Adresszeile ist dann korrekt für das normale Check-in.

Ich hoffe nun sind alle Klarheiten beseitigt, ich musste hier in der Unterhaltung etwas blättern um darauf zu kommen.