Also bei der Betrachtung Flug vs Bahn vs Auto kommt es immer auf den Einzelfall an. Das ist zwar zunächst keine befriedigende Antwort, aber selbst bei gleichen Entfernungen von zwei Strecken kann die konkrete Antwort ganz unterschiedlich ausfallen, je nachdem wie die Flug-, Bahn- und Autobahnbindungen ausgestattet sind.
Grundsätzlich würde ich längere Entfernungen (vl ab 500 km) fliegen. Ich bin sehr oft zwischen Berlin und Stuttgart unterwegs gewesen. Bahn macht keinen Sinn. Ein Flug kostet, wenn man gut bucht, zwischen 80 und 110 Euro. 130 Euro wäre schon viel (alles Hin und Zurück). Eine einfache Bahnstrecke (BahnCards mal außer Acht gelassen) kostet ja schon mehr als 100 / 130 Euro. Ebenso eine Autofahrt. Dennoch bin ich mindestens ein Mal im Jahr mit dem Auto gefahren, um die Strecke zu genießen und die Veränderungen zu sehen. Auf der Linie Berlin - Stuttgart herrscht großer Wettbewerb bei den Fluglinien: Lufthansa, Germanwings, Air Berlin.
Nächstes Beispiel: Stuttgart - München. Macht mit dem Flieger kaum Sinn (obwohl es eine Verbindung gibt). Der Flughafen München ist soweit außerhalb der Stadt, daß man mit der S-Bahn 45 min in die City braucht. Gesamtzeit für den Flug: > 3h. Bahn ist schneller. Mit dem Auto ist man meist auch schneller. Ebenso Stuttgart - Frankfurt. Mit der Bahn 1h. Das schafft der Flieger (inkl. Check-In usw.) nie.
Stuttgart - Düsseldorf wiederum mag ein Grenzfall sein. Mitunter bekommt man eine schnelle Bahnverbindung, die aber u.U. teurer ist als ein günstig gebuchter Flug (mit Lufthansa oder Germanwings). Hier steht das Auto wohl eher an dritter Stelle.
Düsseldorf - Hamburg ist auch ein Grenzfall. Oder Frankfurt - Leipzig. Letzteres könnte mit dem Auto schneller und günstiger sein als mit dem Flieger (Bahnverbindung kenne ich nicht).
Also es kommt auf den Einzelfall an und man sollte einerseits die Gesamtzeit und andererseits den Preis sehen. So mache ich das immer.
In diesem Sinne viel Spaß beim Vergleichen und beste Grüße aus Berlin,
Karsten Diego