Okay, neuer Versuch es für alle zu erklären. 
In jedem Fall findet die Immigration/Passkontrolle in Bangkok statt- korrekt! Vielleicht habe ich mich undeutlich ausgedrückt- Sorry!
ABER, es kommt auch auf die ENDdestination an- und hier wurde nicht geschrieben, wo das Gepäck landen soll. Und da ist der Haken.
Also, entweder man fliegt mit Bangkok Airways nach Phuket oder Koh Samui, so findet die Passkontrolle in Bangkok statt, man selbst bleibt aber im Transitbereich und reist dann am Endziel "richtig" ein (Stichwort Zoll).
Bei Zielen wo es KEINEN Zoll gibt, a la Sukhothai oder Trat, findet neben der Passkontrolle in Bangkok auch die Einreise statt. Der Koffer wird NICHT durchgecheckt, der Passagier muss den Koffer vom Band abholen, durch den Zoll(!!) und ist damit in Thailand eingereist! Danach wird vom neuen eingecheckt. KEINE Airline, egal ob Emirates oder AirBerlin würde dir den Koffer zu diesen Zielen durchchecken- auch wenn sie eine Partnerairline von Bangkok Airways sind.