Hop-on-Hop-off würde bei einem so engen Zeitramen nicht machen. Wir haben schon hin und wieder mal bei den Stopps 20 Minuten auf den Bus gewartet.
Ich war bisher 4 x in San Francisco und bis auf einmal jedes Mal mit dem Auto unterwegs. Damit kannst du schöne Aussichtspunkte für den Golden Gate Bridge anfahren (z. B. China Beach, Conzelman Road) und außer am Fisherman's Wharf kann man eigentlich fast überall gut parken. Und am Fisherman's Wharf haben wir auf der offenen Parkfläche geparkt und das sogar umsonst, weil wir in der Boudin Bakery was gegessen haben (die Clam Chowder ist übrigens sehr empfehlenswert). Hier sollte man aber vielleicht nicht allzu spät ankommen, denn viele Parkplätze gibt es da nicht.
Bei nur einem Tag San Francisco würde ich mit dem Auto den 49 Mile Drive fahren.
Letztlich musst du das natürlich selbst entscheiden. Ich persönlich finde San Diego viel schöner, als LA. Mittlerweile finde ich LA aber wirklich sehr interessant. Ich war 4 x dort und mit jedem Besuch mochte ich LA mehr. LA hat schon viel zu bieten, aber es ist recht zeitintensiv, da alles weiter auseinander liegt und LA ständig Verkehrskollaps hat.